為什么要進行土壤消毒呢？因為在作物種植過程中，特別是重茬種植，土壤狀況不斷惡化，三大問題特別突出，一是土壤中病原菌不斷積累，土傳病害日益加重，直接導(dǎo)致作物爛根、死棵、甚至絕產(chǎn)。二是隨著化肥大量使用，土壤鹽漬化問題嚴(yán)重，導(dǎo)致作物根系不發(fā)達(dá)，黃葉早衰，品質(zhì)變劣，產(chǎn)量大幅度降低。三是連作引起自毒物質(zhì)積累，作物長勢差，衰敗早。
土壤存在的這些問題，通過一些農(nóng)藝措施或物理措施能得到有效緩解或解決，如種植抗病品種、部分蔬菜采取嫁接技術(shù)可以高抗土傳病害、輪作換茬可以減少病原菌的基數(shù)、增施生物菌肥和有機肥能減輕土傳病害和鹽漬化的發(fā)生等。
各地大棚施肥習(xí)慣不同，種植作物不同，土傳病害和鹽漬化的種類、程度也不同，因此要因棚制宜，區(qū)別對待，采取適宜的措施加以解決。
一、對于1-2年新建成的大棚，土傳病害和鹽漬化問題不突出，可以采取增施有機肥和生物菌肥，結(jié)合深翻地的措施？擅慨施用優(yōu)質(zhì)腐熟雞鴨肥10-20方，諾萊仕、三炬微生物菌肥100公斤。定植時，可采用藥劑穴施和蘸盤，如阿米西達(dá)、金雷等蘸盤，穴施生物菌肥等，可大大減少爛根死棵現(xiàn)象。
二、3-5年的大棚，一般土傳病害和鹽漬化中等發(fā)生，蔬菜爛根和黃葉早衰現(xiàn)象不同程度發(fā)生。這樣的大棚單純依靠生物菌防治爛根死棵效果較差，應(yīng)該多措并舉，綜合預(yù)防病害的發(fā)生，如高溫悶棚結(jié)合氰胺化鈣、棉隆等熏棚，能有效預(yù)防多種土傳病害的發(fā)生。同時結(jié)合嫁接和抗病品種，預(yù)防死棵的效果會更好。土壤鹽漬化要減少化肥用量，增施有機肥，進行輪作換茬或種植一茬綠肥作物（如苜蓿、菠菜、玉米等），必要時采用大水壓鹽措施。
三、5年以上的大棚，連作障礙有的已比較嚴(yán)重，尤其是10年左右的，常有黃葉、早衰、爛根、死棵現(xiàn)象，伴有土層表面有白色或紅色或綠色物質(zhì)。此時使用常規(guī)方法消除鹽漬化和土傳病害效果較差，往往事倍功半。解決鹽漬化首先要深翻地，起壟作畦，然后灌大水，通過水的淋溶作用將鹽帶入土壤深層，每年一次。結(jié)合輪作換茬、增施有機肥、大幅減少化肥用量，效果會更加突出。土傳病害十分嚴(yán)重的，要使用棉隆、溴甲烷等熏蒸消毒，結(jié)合金雷或嘧菌酯蘸盤和灌根各一次，爛根死棵現(xiàn)象會得到有效控制，老大棚重新煥發(fā)生機活力不是不可能的。