雖然肥料混用能夠提高肥效，互相補(bǔ)充，但是以下幾種肥料卻不能夠混合使用：
1、農(nóng)家肥不能與草木灰、石灰氮、石灰、鈣鎂磷肥等堿性肥料混用。因?yàn)槿诵蠹S尿中的主要成分是氮，若與強(qiáng)堿性肥料混用，則會(huì)中和而失效。
2、過(guò)磷酸鈣不能與草木灰、石灰氮等堿性肥料混用，否則會(huì)降低磷的有效性。磷礦粉、骨粉等難溶性磷肥也不能與草木灰、石灰氮等堿性肥料混用，否則會(huì)使難溶性磷肥更難溶解，作物無(wú)法吸收利用。
3、鈣鎂磷肥等堿性肥料不能與銨態(tài)氮肥混施。因?yàn)閴A性肥料若與銨態(tài)氮肥料如碳酸氫銨、硫酸銨、硝酸銨、氯化銨等混施，則會(huì)增加氨的揮發(fā)性，從而降低肥效。
4、未腐熟的農(nóng)家肥不能與硝酸銨混施。因?yàn)槲锤斓霓r(nóng)家肥要經(jīng)過(guò)分解腐爛后才能被作物吸收利用。若與硝酸銨混施，未腐熟的農(nóng)家肥在分解腐爛過(guò)程中氮素會(huì)喪失，所以不能同施，否則二者氮素都會(huì)受損，降低肥效。
5、化學(xué)肥料不能與性肥料混用。因?yàn)榛瘜W(xué)肥料有較強(qiáng)的腐蝕性、揮發(fā)性和吸水性，若與根瘤菌等性肥料混合施用，會(huì)殺傷或抑制活菌體使性肥料失效。